1. 멍이나 출혈이 생긴 경우 오메가3는 혈액을 묽게 해주는 역할을 하므로 눈 흰자 위에 핏줄이 터지거나, 피부에 멍이 들거나, 잇몸 출혈이 생기는 경우 위험할 수 있다. 2. 심한 알레르기 증상이 나타나는 경우 오메가3는 정어리나 멸치 등과 같은 어류를 원료로 만든 것이기 때문에 생선이나 해산물 알레르기가 있고 오메가3를 먹고 심하게 붓거나 호흡이 가빠진다면 당장 약을 중단해야 한다. 3. 위장장애가 생긴 경우 오메가3는 지방 성분을 농축해서 만들다 보니 특유의 비릿한 향때문에 위에서 잘 받지 않고 구토나 구역을 유발할 수도 있다. 또 기름 성분때문에 위에서 유화 작용을 하게 되는데 설사와 같은 위장장애가 발생할 수 있다. 이럴 때도 약을 중단해야 한다. 4. 어지러움이나 두통이 생긴 경우 오메가3는 원혈액순환을 돕는데 간혹 혈압이 낮은 사람의 경우 어지럽거나 두통을 호소하기도 해서 이럴 때 계속 먹는 것은 좋지 않다.